Cykl formacyjny „Szkoła Animatora Wieczernik” jest kontynuacją podstawowej formacji dla  uczestników grup Odnowy. W swojej istocie są to rekolekcje, a nie szkoła, w której zdobywa się wiedzę. To dwuletni program formacyjny dla osób pragnących pogłębić swoje życie duchowe, a szczególnie dla osób pragnących duchowo przygotować się do podejmowania różnego rodzaju posługi (np. w grupie modlitewnej, w CF Wieczernik, apostolstwa w świecie). Łącznie z wcześniejszymi etapami formacji, „Szkoła Animatora” przygotowuje do bardziej owocnego odprawienia Ćwiczeń Ignacjańskich prowadzonych przez Księży Jezuitów.

Szkoła Animatora łączy w sobie formację intelektualną i duchową. Formacja duchowa wprowadza na drogę drugiego nawrócenia, polegającego na stałej przemianie człowieka, który umiera dla siebie, a otwiera się na zbawcze działanie Chrystusa. Formacja intelektualna jest wprowadzeniem w istotne treści dotyczące Odnowy w Duchu Świętym, roli animatora i sposobów pracy w grupie.

W programie przewidziana jest też praktyka – posługa jako animator na tygodniowych rekolekcjach REO (w domu rekolekcyjnym) oraz odprawienie (po II roku) Ćwiczeń Ignacjańskich indywidualno-grupowych prowadzonych przez CF Wieczernik. Zalecany jest także udział w weekendach formacyjnych: O Spotkaniu Modlitewnym, O Posłudze Prorockiej oraz w Rekolekcjach o rozeznawaniu.